To Doリスト(兼備忘録、検討中のメモ) †
学会発表準備 †
- 口頭&ポスター
- ゲノム微生物学会
- 細菌学会 (17分、投稿中の内容も追加するかも)
- (来年度、国立感染研・長崎大の中でのセミナーにも使用する)
九工大での特別講演(3/4 13:00-14:20) †
- バイオ統計フォーラムの内容 + 細菌学会・ゲノム微生物学会の内容 + Perspective
ピロリ菌のゲノム解析新プロジェクト †
- 大分大学、Swansea Univeristyとの共同研究
- 大分大学から頂いたデータを解析開始
- 2月のUK滞在中に集中的に研究を進める
M2の米澤さんのプロジェクト †
- 3月中旬に初稿を完成 => 共同研究者に報告し、臨床面での助言・指導を頂く => 英語校正 => 投稿
3本の論文 †
- Relation between recombination and diversifying selection
- Comparison of recombination landscapes among the 10 bacterial species
喘息の肺音解析プロジェクト †
次世代シーケンサ関連 †
- exome, RNA-seq, BS-Seq, ChIP-Seq
- 癌細胞特異的なヒストン修飾の探索と、その遺伝子発現との関係
- 癌細胞特異的なDNAメチル化とヒストン修飾の組み合わせ
ヒトゲノム医学の新プロジェクト †
授業 †
- 今年度の講義(大学院)の改善
- 学部生演習の50分x2コマ化への対応
研究助成金申請 †
- 石橋
- 民間の助成(2015年度が研究のスタート、として)
放射線科からのデータ解析依頼 †
感染制御学講座からの依頼 †
ピロリ菌のメチローム解析 †
国立感染研との新規共同研究 †
将来の科研費(分担) †
- 微生物学分野の新学術領域立ち上げに向けての協力
- 感染症関連(N大)の分担?
- バクテリアゲノム解析(painting)の分担?
将来の科研費に向けた準備 †
- 感染症分野の疫学とゲノムの統合DB解析、国立感染研との共同研究
九大生体防御医学研セミナー †
- 集団レベルのゲノムデータをどう生かすか:病原細菌のゲノムワイド関連解析と遺伝子フローを例に
- 集団レベルのゲノムデータ解析の走り:マイクロアレイデータ解析
- バイオ統計フォーラムのイントロ(集団レベルの全ゲノムデータ)
- human vs Modernizing medical microbiology
- オリジナルな研究を育て、国際経験を積むのを最優先課題に、病原細菌を使った研究をまずは発展。
- association mapping
- MBE 2013 (PaaboのNature, Science paperを引用して。あらゆる集団レベルのゲノムデータを解析する上での第1ステップ)
- (MBE 2014は「組換え」に絞った別の機会に)
新規共同研究 †
- エピジェネティクス関連で、2件を要検討
- 感染症関連で、2件(含N大)を要検討
- microbial population genomicsで、1件を要検討
大学院GPE †
オフィスアワー †